微生物中毒一般是由外來因素造成。特別是工業區內的污水處理廠，更容易由于進水中含有毒物質，超過生化系統正常運行承受能力，引起活性污泥中毒辣，生化系統受沖擊，運行異常，出水超標。
怎么判斷微生物中毒
1.觀察曝氣池與終沉池變化：
曝氣池污泥呈土黃褐色，泡沫發黃，個體增大，同時數量增多，占到池面30%～50%；終沉池上清液混濁，泥位上升，出水有少量SS帶出。可判斷為活性污泥中毒初期。
當曝氣池活性污泥由土黃褐色急劇變成了黑色，發臭，泡沫數量急劇增多，覆蓋池面90%以上；終沉池出水絮體很多，污泥的結構松散和體積膨脹，表面有大量泡沫形成的泥塊浮在上面，污泥沉降性能很差時，則到了中毒中后期。
2.理化指標數據分析
采取活性污泥的生物相觀察、監測活性污泥的耗氧速率、DO、污泥沉降比、污泥容積指數和密度指數、污泥的沉降速度等措施做進一步的理化分析，可大致判定生物系統微生物是否中毒，中毒程度如何，活性污泥中的微生物的變化過程。
3.重金屬指標指標分析
考慮到重金屬分析儀器價格較高，可采用相對應水質快速檢測試劑管作初步檢測，再送檢或直接將水樣郵寄專業水處理公司做檢測分析。
微生物中毒怎么辦
1.采用間歇式進水，盡量減少進水，防止有毒害物質進入。
2.減少回流及加大排泥
減少污泥回流量，增加終沉池惰性污泥的排泥時間，進一步減少已留存在終沉池的受中毒污泥回到曝氣池中，適當降低曝氣池的污泥濃度，對污水中的污染物質進行分離或排放，控制污泥膨脹和污泥上浮，將中毒危害控制在最低限度。
3.活性污泥微生物馴化培養
在上述措施實施后，若中毒程度不深，可采取間歇進水、間歇曝氣的方式對曝氣池進行控制，將好氧池DO保持在2～3 mg/l，以加快活性污泥微生物的增長。
4.投加微生物激活菌、促生劑、解毒劑
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