關于污水脫氮處理，特別是生活污水，基本上都需要添加外來碳源作為微生物營養劑，促進微生物脫氮治理。而近年來，不乏新聞報道稱，某某食品企業與某某污水處理廠達成協作，污水處理廠中的脫氮菌靠“喝啤酒、喝豆汁、喝醋、吃糖果、吃淀粉”互補式處理污水補充碳源，而狂省十、百、千萬元的新聞已經屢見不鮮。但，目前大部分污水處理廠仍需要購買外來碳源。
1.污水不是純碳源，預處理后仍存在雜質，影響原污水脫氮除磷。可能會增加額外負荷，需要對水質及污水處理廠運營能力做評估。
2.出水水質、水量波動大。當生產企業排放廢水超過污水處理廠接收能力或協商限值時，可能會對后續污水處理系統造成沖擊，導致處理不達標。
3.即使前面兩個問題經預處理得到解決，仍存在運輸不方便，成本高的問題。污水廠周邊沒有有機廢水來源豐富的企業，需要有專門的管道運輸，還需要注意途中不能有泄露，如果距離太遠，運輸上不方便，成本也高。
4.相關制度還沒有完善，企業與污水廠間仍存在不確定性，也可能彼此不知道對方的存在，需要有合適的中間人（需經過環保部門或水務部門等主管部門同意）。
污水廠實現碳源自由，除了需要尋找周邊符合條件的企業外，還要求自身實力過硬，接得住，還需要符合相關政策規章要求，得到監管部門許可。因此，現實中仍有許多污水處理廠需要購買外來碳源。
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